Introducción a la secuenciación metagenómica de nueva generación (mNGS)

La secuenciación metagenómica de nueva generación (mNGS) ha llegado para cambiar las reglas del juego en el diagnóstico de infecciones. Este innovador método permite el análisis exhaustivo de todos los ácidos nucleicos (ADN y ARN) presentes en una muestra clínica, generando una impresionante cantidad de entre 10 y 20 millones de secuencias por muestra. Lo más asombroso es que puede aplicarse a diversas muestras, desde líquido cefalorraquídeo hasta plasma, secreciones respiratorias, orina, heces y tejidos.

Desarrollo de la prueba de mNGS en UCSF

Investigadores del Centro de Diagnóstico de Precisión de Nueva Generación de la UCSF en San Francisco han desarrollado una prueba de mNGS que puede detectar lecturas de secuencia de una amplia variedad de patógenos, facilitando la identificación precisa de la causa de infecciones. Inicialmente, el enfoque se centró en el líquido cefalorraquídeo, ayudando a diagnosticar condiciones críticas como meningitis y encefalitis. Posteriormente, el equipo expandió su aplicación a un test clínico en plasma, diseñado para detectar rápidamente virus de ADN, bacterias, hongos y parásitos que podrían provocar sepsis o infecciones severas en otros órganos.

Análisis de datos con SURPI+

Para analizar los datos obtenidos mediante mNGS, los científicos utilizan un software de bioinformática conocido como SURPI+ (SURPI PLUS), lo que les permite ofrecer resultados rápidos y eficaces. En un estudio reciente publicado en Nature Medicine, demostraron que su prueba para líquido cefalorraquídeo identificaba con una precisión asombrosa el 86% de las infecciones neurológicas.

Avances en la detección de neumonía

No se detienen ahí. Actualmente, los investigadores están trabajando en la validación de pruebas clínicas para detectar todos los microorganismos que causan neumonía en fluidos respiratorios, incluyendo lavado broncoalveolar y aspirados traqueales. Un estudio relacionado publicado en Nature Communications llevó a cabo la identificación de patógenos responsables de neumonía utilizando mNGS, además de automatizar el proceso y acelerar la generación de resultados.

Futuro de la mNGS en hospitales

La mNGS está destinada a convertirse en una herramienta imprescindible en los hospitales del futuro, donde el diagnóstico precoz es fundamental para salvar vidas. ¿Estás listo para el futuro de la medicina? ¡No te quedes atrás y sigue de cerca esta emocionante tecnología!