Salud

¡Descubren 7 biotipos del virus de la PPA gracias al aprendizaje automático!

2024-09-25

Introducción

En 2007, Georgia fue el epicentro de un devastador brote de peste porcina africana (PPA), una enfermedad altamente mortal que afecta tanto a cerdos domésticos como a jabalíes, provocada por el virus de la peste porcina africana (vPPA). Desde ese año, el vPPA se ha dispersado por todo el mundo, causando estragos en las industrias porcícolas, con un impacto económico profundo y una creciente preocupación sanitaria.

Clasificación Tradicional y Nuevas Propuestas

Tradicionalmente, el vPPA se clasificaba en 25 genotipos diferentes. Sin embargo, un nuevo enfoque propuesto ha recategorizado estas cepas en solo 6 genotipos, basándose únicamente en las secuencias proteicas de p72. Esta simplificación ha sido objeto de controversia, pues el genoma del vPPA es considerablemente amplio, codificando entre 150 y 200 genes. Esto significa que las clasificaciones basadas únicamente en un único gen pueden ser insuficientes y engañosas, dado que cepas con el mismo p72 a menudo tienen mutaciones importantes en otras partes de su genoma.

Método Innovador de Clasificación

En este estudio innovador, se presenta una nueva clasificación del vPPA, utilizando un método más exhaustivo que analiza el total del proteoma. Se realizó un análisis de similitudes entre secuencias proteicas homólogas de una base de datos compuesta por las secuencias predichas de 220 genomas reanotados del vPPA. Para este análisis se aplicaron pesos a las matrices de identidad de proteínas que se promediaron para crear una matriz de identidad entre genomas. Posteriormente, se utilizó un algoritmo de aprendizaje automático no supervisado llamado DBSCAN, que permite clasificar y separar los genomas en grupos distintos.

Resultados y Conclusiones

¡Los resultados son sorprendentes! Se determina que todos los genomas del virus de la PPA, que están disponibles en la actualidad, pueden ser clasificados en 7 biotipos distintos. Este hallazgo no solo mejora nuestra comprensión de la diversidad del virus, sino que también puede revolucionar la manera en que se abordan la prevención y el control de la PPA en el futuro.

Implicaciones para la Salud Animal y la Seguridad Alimentaria

El estudio destaca la necesidad de desarrollar estrategias más efectivas y personalizadas de manejo de la PPA, especialmente en regiones donde la enfermedad ha tenido un impacto devastador. La investigación continúa y la comunidad científica está ansiosa por ver cómo este nuevo enfoque cambiará el panorama de la epidemiología porcina. La urgencia de abordar la PPA es más relevante que nunca, dadas las implicaciones que tiene para la seguridad alimentaria y la salud animal a nivel global.