Celý projekt výstavby Vltavské filharmonie, schválený magistrátem, bude rozdělen na deset investičních akcí, které budou realizovány magistrátem a dopravním podnikem. Z dvanácti miliard korun vyčleněných na samotnou výstavbu filharmonie město počítá s další miliardou na uvedení budovy do provozu.

Zbytek peněz bude určen na úpravy komunikací, nábřeží a stanice metra. Projektová dokumentace, kterou připravuje dánské studio Bjarke Ingels Group, je odhadována na přibližně miliardu korun bez daně.

Podle předpokladů by úpravy před filharmonií měly stát zhruba 410 milionů korun bez DPH. Mezi další nezbytné investice patří například přesun vzduchového systému ochranného systému metra, který bude stát 420 milionů korun bez DPH, a přeložka tramvajové trati za 230 milionů korun bez DPH. Dále se plánuje vybudování automobilového tunelu na nábřeží Kapitána Jaroše a nový sjezd z Hlávkova mostu, což vyjde na celkem 1,72 miliardy korun bez DPH. Kromě toho se vybuduje kolektor na nábřeží za 190 milionů korun bez DPH.

Další plánované investice neseznámí přímo s filharmonií, ale jsou důležité pro koordinaci. Patří sem přestavba vestibulu metra Vltavská s novým severním výstupem, která vyjde na 480 milionů korun bez DPH, a úpravy komunikací v okolí za 180 milionů korun bez DPH.

Magistrát rovněž schválil založení nadačního fondu, do kterého město investuje 30 milionů korun a prostřednictvím které budou shromažďovány příspěvky na stavbu filharmonie od soukromníků a firem. V jeho správní radě zasednou významné osobnosti, jako zakladatel firmy Avast Pavel Baudiš, poslanec a ředitel festivalu Pražské jaro Roman Bělor, podnikatelka a bývalá politička Jana Marco, lékařka Petra Tesařová a ředitelka festivalu Designblok Jana Zielinski. V dozorčí radě pak zasednou například bývalý ministr financí Miroslav Kalousek a bývalý guvernér České národní banky Zdeněk Tůma.

Předseda pražského ANO a kontrolního výboru zastupitelstva Ondřej Prokop vyjádřil obavy ohledně schopnosti současného vedení města dotáhnout projekt do konce. "Praha si moderní koncertní sál zaslouží, ale historie ukazuje, že město čelí mnoha problémům s realizací velkých investic jako jsou metro D nebo městský okruh. Lze věřit, že právě Vltavská filharmonie bude tím, co se podaří dokončit?" dodal.